JEROME DUPUIS.

Maitre de Conférences à l'Institut de Mathématiques de Toulouse

Mail: dupuis@math.univ-toulouse.fr
Bureau: 119 batiment 1R1 1eme etage.
Telephone: +33(0)5 61 55 69 84
Télécopie: +33(0)5 61 55 60 89


Adresse postale:

Laboratoire de Statistique et Probabilités
Institut de Mathématiques
Batiment 1R1, Université Paul Sabatier
118, Route de Narbonne
31062 TOULOUSE Cedex 4 France


I. Enseignement.

Liste des enseignements dispensés par matières et par niveaux.

  • Statistique Bayésienne
    en Maitrise d'Ingénierie Mathematiques, M1 IUP SID, DEA de Probabilités et Statistique, M2R Epidémiologie.

  • Statistique inférentielle (estimation et tests)
    en Licence d'Ingénierie Mathematiques, L3 et L2 Biologie.

  • Séries chronologiques
    en M1 IUP SID.

  • Théorie des sondages
    en M1 IUP SID.

  • Mathematiques générales
    en L1 math et L1 Biologie.

    II. Recherche.

    1. Centres d'intérêt.


    - Modélisation de phénomènes biologiques complexes.
    - Modèles de capture-recapture, estimation de la bio-diversité.
    - Modèles à données manquantes (missing data models).
    - Statistique Bayésienne et algorithmes MCMC.

    2. Publications.


    2.1 Publications dans des revues internationales.


  • Dupuis, J. (1995)
    Bayesian estimation of movement and survival probabilities from capture-recapture data.
    Biometrika. Vol. 82, pp 761-772.

  • Dupuis, J. (1997)
    Discussion of the paper of Meng and Van Dyk: ``The EM algorithm: an old folk-song sung to a fast new tune".
    J.R.S.S. B . Vol. 57, No 3, pp. 553.

  • Dupuis, J. (1997)
    Bayesian test of homogeneity for Markov chains.
    Statistics and Probability Letters. Vol. 31, pp 333-338.

  • Dupuis, J (2002).
    Prior distributions for stratified capture-recapture models (with discussion).
    Journal of Applied Statistics. Vol. 29, pp 225-237.

  • Dupuis, J. (2002)
    Response to Carl Schwarz.
    Journal of Applied Statistics. Vol. 29, pp 241-244.

  • Dupuis, J; Badia, J; Maublanc ML; Bon, R. (2002)
    Spatial fidelity of mouflon: a bayesian analysis of an age-dependent capture-recapture model.
    JABES Vol. 7, No 2, pp 277-298.

  • Dupuis, J; Robert, C. (2003)
    Variable selection in qualitative models via an entropic explanatory power.
    Journal of Statistical Planning and Inference. Vol. 111, pp 77-94.

  • Dupuis, J; Joachim, J. (2006)
    Bayesian estimation of species richness from quadrat sampling in presence of prior information.
    Biometrics Vol. 62, pp 706-712.

  • Dupuis, J; Schwarz, C. J. (2007)
    A Bayesian approach to the Multistate Jolly-Seber capture-recapture model .
    Biometrics (2007). Vol. 63, pp 1015-1022

  • Dupuis, J., Bled, F., and Joachim, J. (2010).
    Impact of climatic variations on bird species occupancy rate in a southern European forest. .
    Biodiversity and Conservation, 20, Issue 6, pp 1203-1224

  • Dupuis, J; Bled, F; Joachim, J. (2011)
    Estimating occupancy rate of spatially rare or hard to detect species: a conditional approach .
    Biometrics Vol. 67, pp 290-298

  • Dupuis, J; Goulard, M. (2011)
    Estimating species richness from quadrat sampling data: a general approach .
    Biometrics ol. 67, pp 1489-1497

  • Martin, J., Bled, F., Dupuis, J., Gardner, B., et al. (2014)
    Estimating Upper Bounds for Occupancy and Number of Manatees.
    PLOSone doi.org/10.1371

  • Dreyfus, I., Chouquet, C., Dupuis, J., Mazereew, J. et al. (2014).
    Prevalence of ichtyosis in France: a study using capture-recapture methods.
    Orphanet Journal or Rare Disease doi.org/0.1186/1750-1172-9-1.

    2.2 Articles déposés sur le site HAL du CNRS



  • Dupuis, J. (2008)
    On the bayesian estimation of species richness and related quantities: the homogeneous case. Hal-00281829.

  • Dupuis, J. and Joachim, J. (2015).
    Testing biological hypotheses in site occupancy models : a Bayesian approach. Hal-01241022.

  • Dupuis, J. (2017).
    Two prior distributions for incorporating information on a parameter θ ∈ [0, 1]. Hal-01534675.

  • Dupuis, J. (2017).
    Estimating the size of a population from three incomplete lists : a Bayesian approach. Hal-01613642.

  • Dupuis, J. (2020).
    Estimating the size of small populations from incomplete lists via graphical models. Hal-02925222

    2.3 Rapports techniques



  • Dupuis, J.
    Bayesian test of homogeneity for Markov chains with missing data by Kullback proximity.
    Publication No 9457 du CREST/ENSAE, Paris (1994).

  • Dupuis, J.
    A global optimization algorithm of the likelihood for Markov models with randomly missing data.
    Publication LSP (2003).

  • Dupuis, J.
    Maximum likelohood estimator of transition probabilities from capture-recapture data via SEM.
    Publication No LSP-2003-9, Toulouse (2003).

  • Dupuis, J; Joachim J.
    Bayesian estimation of species richness.
    Publication No LSP-2003-10, Toulouse (2003).

    2.4 Publication dans un livre.



    Dupuis, J. (2002)
    Estimation Bayesienne d'un modele Markovien: une application en dynamique des populations.
    Dans ` Méthodes Bayésiennes en Statistique '. JJ. Droesbecke, J. Fine, et G. Saporta Editeurs. Technip, Paris. pp 331-351

    2.5 Articles non soumis.



  • Dupuis, J.; Moukadem, M. (1994)
    Bayesian test of homogeneity for Markov chains by Kullback proximity with an application to a medical follow-up.


  • Dupuis, J. (1995)
    Bayesian test of a leader effect in the closed Arnason-Schwarz model.


    3. Encadrement de thèse.



    Co-directeur (avec Emmanuelle Cam) de la thèse de Florent Bled soutenue le 18 mai 2010 a l'UPS (Toulouse)
    Sujet de la thèse: Développement et applications de modeles d'occupation de sites.

    4. Principales collaborations de 1995 à 2020.


    Christian Robert (Université Paris Dauphine); Carl Schwarz (Université Simon Fraser, Vancouver);
    Jean Joachim et Michel Goulard (INRA); Emmanuelle Cam (Université Paul Sabatier).