Thèmes de recherche
Statistics of Post-Genomic Data, Biostatistics
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Lê Cao K. A., Boistard S., Besse P. (2011)
Sparse PLS Discriminant Analysis: biologically relevant feature selection and graphical displays for multiclass problems
BMC Bioinformatics 2011, 12:253.
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Dressaire C., Laurent B., Loubière P., Besse P., Cocaign-Bousquet M. (2010).
Linear covariance models to examine the determinants of protein levels in Lactococcus lactis, Molecular BioSystems, 6, 1255-1264.
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González I., Déjean S., Martin P. G. P., Gonçalves O., Besse P., Baccini A. (2009).
Highlighting relationships through Regularized Canonical Correlations Analysis : applications to high throughput biology data, Journal of Biological Systems, 17(2), pp 173-199.
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Lê Cao K. A., Martin P., Robert-Granié C., Besse P. (2009) Sparse canonical methods for biological data integration: application to a cross-platform study, BMC Bioinformatics, 10:34.
- Bonnet A., Lê Cao K.-A., San Cristobal M., Benne F., Robert-Granié C., Law-So G., Fabre S., Besse P., De Billy E., Quesnel H., Hatey F., Tosser-Klopp G. (2008) In vivo gene expression in granulosa cells during pig terminal follicular development, Reproduction, 136 (2), 211-224.
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Lê Cao K. A., Rossouw D., Robert-Granié C., Besse P. (2008). A sparse PLS for variable selection when integrating Omics data, Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology, Vol. 7 : Iss. 1, Article 35.
- Dressaire C., Redon E., Milhem H., Besse P., Loubière P., Cocaign-Bousquet M. (2008). Growth rate regulated genes and their wide involvement in the Lactococcus lactis stress responses, BMC Genomics, 9:343.
- Lê Cao K.-A., Gonçalves O., Besse P., Gadat S. (2007). Selection of Biologically Relevant Genes with a Wrapper Stochastic Algorithm, Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology , Vol. 6 : Iss. 1, Article 29.
- Baccini A., Besse, P., Déjean S., Martin, P. (2007). Clustering Time-Series Gene Expression Data Using Smoothing Spline Derivatives, EURASIP Journal on Bioinformatics and Systems Biology, article ID 70561.
- Martin P., Guillou H., Lasserre F., Déjean S., Lan A., Pascussi J.-M., San Cristobal M., Legrand P., Besse P., Pineau T. (2007). Novel aspects of PPARalpha-mediated regulation of lipid and xenobiotic metabolism revealed through a nutrigenomic study, Hepatology, 54(3), 767-777.
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Laurell H., Bouisson M., Berthélemy P., Rochaix P., Déjean S., Besse P., Susini C., Pradayrol L., Vaysse N., Buscail L. (2006). Identification of biomarkers of human pancreatic adenocarcinomas by expression profiling and validation by gene expression analysis in Endoscopic Ultrasound-guided Fine Needle Aspiration samples, World Journal of Gastroenterology, 12(21), 3344-3351.
- Baccini A., Besse P., Déjean S., Martin, P., Robert-Granié C. et San Cristobal M.
Stratégies pour l'analyse statistique de données transcriptomiques,
Journal de la Société Française de Statistique , 146, 4-44 (2005).
Industrial Applications, Data Mining 
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Baccini A., Besse P. (2011). Statistique Descriptive Mutidimensionnelle, in Encyclopédie des Techniques de l'Ingénieur.
- Besse P., Milhem H., Mestre O., Dufour A., Peuch V.-H. (2007). Comparaison de techniques de Data Mining pour l'adaptation statistique des prévisions d'ozone du modèle de chimie-transport MOCAGE, Pollution Atmosphérique, 195 285-292.
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Besse P., Le Gall, C.
Application and reliability of change-point analyses for detecting a defective in intragated circut manufacturing series, Communication in Statistics, Simulation and Computation , 35, 2, (2006).
- Besse, P.; Raimbault, N.
Comparisons of split-linear fitting of wind curves,
Journal of Data Science, 4, (2006).
- Besse, P.; Le Gall, C.; Raimbault, N.; Sarpy, S.
Data Mining & Statistique, avec discussion,
Journal de la Société Française de Statistique, 142, 5-35 (2001).
- Besse, P.
Data Mining & Statistique : Réponse aux intervenants
Journal de la Société Française de Statistique, 142, 89-95 (2001).
- Bergeret, F.; Besse, P.
Recherche d'une étape défaillante dans un procédé industriel~: quand le désordre est source d'information,
Revue de Statistique Appliquée, 47, 27-37 (1999).
- Bergeret, F.; Besse, P.
Simulated annealing, weighted simulated annealing and genetic algorithm at work,
Computational Statistics, 12, 447-465 (1997).
Multivariate Statistics, Functional Data Analysis
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P. Besse, H. Cardot (2009). Statistical modeling of functional data, in Data Analysis, (Eds. G. Govaert), Wiley.
- Besse, P.; Cardot, H. ; Faivre, R. ; Goulard, M.
Statistical modeling of functional data ,
Applied Stochastic Models in Business and Industry, 21, 165-173 (2005).
- Besse, P.; Cardot, H.
Modélisation statistique de données fonctionnelles in
Analyse de données, 167-198, Edt. G. Govaert, Hermes (2003).
- Antoniadou, A.; Besse, P.; Fougères, A.-L.; Le Gall, C.; Stephenson, D.
L'Oscillation Atlantique Nord (NAO) et son influence sur le climat européen,
Revue de Statistique Appliquée, 49, 39-60 (2001).
- Besse, P.; Cardot, H.; Stephenson, D.
Autoregressive forecasting of some functional climatic variations,
Scandinavian Journal of Statistics, 4, 673-688 (2000).
- Besse, P.; Cardot, H.; Ferraty, F.
Simultaneous nonparametric regressions of unbalanced longitudinal data,
Computational Statistics and Data Analysis, 24, 255-270 (1997).
- Besse, P.; Cardot, H.
Approximation spline de la prévision d'un processus autorégressif fonctionnel d'ordre 1,
Canadian Journal of Statistics, 24, 467-487 (1996).
- Baccini, A.; Besse, P.; Falguerolles, Antoine de.
A L1-norm PCA and a heuristic approach,
Ordinal and Symbolic Data Analysis, Diday et al. eds, Springer, 359-368 (1996).
- Besse, P.; Ferraty, F.
Curvilinear fixed effect model,
Computational Statistics, 10, 339-351 (1995).
- Besse, P.
Models for multivariate analysis,
Compstat94, Dutter et Grossmann eds, Physica-Verlag, 271-285 (1994).
- Besse, P.
Insight of a dreamed PCA,
SEUGI/CLUB SAS, Proceedings, 744-759 (1994).
- Besse, P.; Falguerolles, A. de.
Application of resampling methods to the choice of dimension in PCA,
Computer Intensive Methods in Statistics, Haerdle et Simar eds, Physica-Verlag (1993).
- Besse, P., Ferré, L.
Sur l'usage de la validation croisée en ACP,
Revue de Statistique Appliquée, 1, 71-76 (1993).
- Besse, P.
PCA stability and choice of dimensionality,
Statistic & Probability Letter, 13, 405-410, (1992).
- Besse, P.
Approximation spline de l'analyse en composantes principales d'une variable aléatoire hilbertienne,
Ann. Fac. Sci. Toulouse, V. Ser., Math. 12,(1991), 329-349.
- Besse, P.; Caussinus, H.; Ferré, L.; Fine, J.
Principal components analysis and optimization of graphical displays,
Statistics, 19, 301-312 (1988).
- Besse, P.; Caussinus, H.; Ferré, L.; Fine, J.
Sur l'utilisation optimale de l'analyse en composantes principales,
C. R. Acad. Sci., 304, 459-462 (1987).
- Besse, P.; Ramsay, J.O.
Principal components analysis of sampled functions,
Psychometrika, 51, 285-311 (1986).
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